El reglamento interno del Colegio Marina de Chile tiene como objetivo promover la convivencia escolar, el respeto mutuo y la prevención de la violencia. También busca fomentar una conciencia ecológica y el cuidado del medio ambiente. Establece derechos y deberes para profesores, estudiantes y padres, así como protocolos de acción ante faltas. Es obligatorio para todos los miembros de la comunidad educativa y se basa en principios legales e institucionales del país. Su elaboración se realizó con la participación de todos los estamentos y en concordancia con el Proyecto Educativo Institucional (PEI).